海産哺乳類の一種であるジュゴンは、インド洋から太平洋の熱帯域に生息し、国内では南西諸島の沿岸域に僅かに生息する。日本のジュゴンは東太平洋地域における北限の個体群で、現在は絶滅が危惧され、国内では天然記念物（文化財保護法）や沖縄県希少動植物保護条例で指定希少野生動植物種に、IUCN（国際自然保護連合）のレッドリストでは南西諸島の地域個体群は絶滅危惧IA類にそれぞれ指定されている。今回は、先島諸島（八重山諸島、宮古諸島）での再発見などを中心に、環境省や沖縄県が実施している調査結果、久米島での再発見など現在の生息状況などについて紹介する。